目的：分析2013—2019年北京市≥60岁老年人流感疫苗接种情况，探究因不同疾病住院老年人的接种趋势变化。方法：从2013—2019年北京市老年人流感疫苗接种信息登记数据库和2013—2019年北京市城镇职工基本医疗保险数据库分别提取老年人流感疫苗接种信息和住院信息后合并分析，比较因不同疾病住院的老年人的流感疫苗接种趋势，并描述2018—2019年流感季接种人群的分布情况。结果：北京市因心血管疾病、脑血管疾病、呼吸系统疾病和糖尿病住院的老年人的流感疫苗接种率分别为14.6%、13.4%、13.4%和11.8%,其中因心血管疾病住院老年人连续六个流感年度接种率均保持在最高，因糖尿病住院人群流感疫苗接种率保持在最低且年均下降幅度最大（-7.85%）。2018—2019年流感疫苗接种人群分布情况在不同年龄、性别、住院结局和合并症严重程度中差异有统计学意义。在因4种疾病住院的老年人中，70～79岁老年人接种率均为最高，而60～69岁老年人接种率均为最低。在因呼吸系统疾病住院的老年人中男性流感疫苗接种率优于女性，而在因糖尿病或心血管疾病住院的人群则表现相反。住院结局较差的老年人接种率更低。糖尿病患者中无共病的接种率最低（7.9%）。结论：北京市2013—2019年因不同疾病住院的≥60岁老年人流感疫苗接种率整体呈下降趋势，应重点关注糖尿病和60～69岁老年人群的流感疫苗接种，并开展更多流感疫苗保护作用研究以支持流感疫苗在慢性病人群中的普及。