【摘 要】
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目的基于TCGA数据库分析探讨免疫相关lncRNA在肝细胞癌(肝癌)组织中的表达及其在预后中的价值。方法从TCGA数据库收集肝癌转录组学表达数据并从临床资料中筛选免疫相关lncRNA。对差异表达的免疫相关lncRNA进行总体生存预后因素的Cox回归分析,筛选预后相关lncRNA,然后进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,寻找免疫相关lncRNA可能调控的通路。结果Cox回归分析筛选出20个免疫相关lncRNA与肝癌患者预后相关,风险分层是患者的独立预后指标(HR=1.
【机 构】
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复旦大学附属华山医院普通外科复旦大学器官移植研究所
【基金项目】
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国家自然科学基金(81873874,81773089,82071797),上海申康医院发展中心临床三年行动计划(SHDC2020CR2021B)。
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目的基于TCGA数据库分析探讨免疫相关lncRNA在肝细胞癌(肝癌)组织中的表达及其在预后中的价值。方法从TCGA数据库收集肝癌转录组学表达数据并从临床资料中筛选免疫相关lncRNA。对差异表达的免疫相关lncRNA进行总体生存预后因素的Cox回归分析,筛选预后相关lncRNA,然后进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,寻找免疫相关lncRNA可能调控的通路。结果Cox回归分析筛选出20个免疫相关lncRNA与肝癌患者预后相关,风险分层是患者的独立预后指标(HR=1.
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