二代测序和免疫组织化学在子宫内膜癌分子分型中的比较

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目的

探讨子宫内膜癌不同技术方法分子分型的差异以探索符合国情的分子分型方案。

方法

收集复旦大学附属妇产科医院病理科2021年4月至2022年3月诊断的子宫内膜癌254例,采用二代测序和免疫组织化学检测综合方案进行分子分型,并以POLE和TP53突变频率≥20%设定为Sanger测序检测极限值模拟其结果,比较不同组合方案下分子分型结果。

结果

254例子宫内膜癌患者,年龄24~89岁,平均年龄51岁。包含有POLE的第9~14号外显子、TP53全外显子和微卫星不稳定(MSI)检测的二代测序panel为较好的独立解决方案,结合MSI片段分析检测和常规免疫组织化学初筛为最佳的综合解决方案,和癌症基因组图谱(TCGA)数据及近期文献比对有最佳符合率,POLE超突变型、错配修复缺陷型、TP53突变型及非特异分子特征型占比分别为11.4%(29/254)、31.5%(80/254)、22.4%(57/254)和34.6%(88/254);如改用Sanger测序进行POLE和TP53突变检测,则分别为9.1%(23/254)、31.5%(80/254)、12.9%(33/254)和46.6%(118/254),大幅度增加了非特异分子特征型的数量;如采用Sanger测序检测POLE,其余分型均用免疫组织化学检测替代,则分别为9.1%(23/254)、42.2%(92/218)、13.8%(35/254)和40.9%(105/254),将增加错配修复缺陷组的假阳性判断。

结论

包含MSI检测的中小型二代测序panel为分子分型的较好解决方案,Sanger测序对POLE突变检测目前可满足基本要求,但对TP53突变检测灵敏度不够,和p53免疫组织化学判断TP53突变效率相当。进一步优化含MSI检测和POLETP53全外显子的中小型二代测序方案是未来符合国情的最优选择。

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