宏基因组测序分析奶牛运动场土壤抗生素抗性基因

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[目的]探究规模化奶牛场运动场内粪尿污染的土壤中抗生素抗性基因情况。[方法]采集北京地区某规模化奶牛运动场中心至外围3个不同半径位置的土壤进行宏基因组测序,在微生物组成研究基础上进行抗性基因(ARGs)功能注释。[结果]土壤中抗性基因检出率最高的是2和,注释为利福霉素抗性基因,耐药菌分别为诺卡氏菌属和双歧杆菌属。其次是和,注释为苯丙醇类、二氨基嘧啶、氟喹诺酮、四环素类、吖啶染料、大环内酯类抗生素,显示了多重耐药风险较高,耐药菌株主要为铜绿假单胞菌。此外还发现从运动场中心至外围土壤中抗性基因逐渐增多,可能是由于土壤内粪尿逐渐扩散富集作用造成的。[结论]通过分析发现该奶牛场土壤中利福霉素、苯丙醇类、氟喹诺酮类、四环素类、大环内酯类、氨基糖苷类抗生素耐药基因数量多。
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