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重大突发性公共卫生事件具有突发性、危害巨大性和治理综合性,其审计工作也具有突发性、重要性和复杂性。跟踪审计提前介入、事中监督,发现问题可以及时整改,能充分发挥"免疫系统"功能,给国家财政、人民人身和财产安全提供保障。探讨了如何更好地利用跟踪审计应对重大突发性公共卫生事件,期望跟踪审计发挥更大作用。