结膜炎分感染性和非感染性两大类。感染性结膜炎又分为细菌性结膜炎、病毒性结膜炎和衣原体感染性结膜炎等，治疗主要根据病原体进行治疗，必要时辅助人工泪液等支持治疗。
　　1.细菌性结膜炎 主要症状为有显著的结膜充血及黏液脓性分泌物，其病原微生物为葡萄球菌、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌等。细菌性结膜炎常用的抗生素药物有氨基糖苷类（如庆大霉素、新霉素、妥布霉素等）、氟喹诺酮类（如加替沙星、诺氟沙星、氧氟沙星等）、酰胺醇类（如氯霉素）、四环素类、大环内酯类（如红霉素、利福平）等。首次治疗病原不明确时，应首选广谱抗生素，提倡不同种类抗生素联合用药，以局部用药为主，对严重病例应根据致病菌药物敏感试验用药。
　　2.病毒性结膜炎 可由腺病毒、单纯疱疹病毒和水痘一带状疱疹病毒等引起。严重的病毒性结膜炎患者可诉有明显畏光和异物感，患者的结膜表面可有纤维蛋白的假膜和炎性细胞和成病灶性角膜炎症。急性期的治疗可使用抗病毒药物，如干扰素滴眼剂、0.1%的阿昔洛韦滴眼液及更昔洛韦眼用凝胶等。并发细菌感染时加用抗菌滴眼液治疗。出现严重的假膜时可考虑使用皮质类固醇眼液，但应密切注意皮质类固醇的不良反应，如眼压升高、病毒感染加重等。
　　3.衣原体感染性结膜炎 可使用15%的磺胺醋酰钠滴眼液或0.1%的利福平滴眼液。
　　非感染性结膜炎与免疫反应密切相关，临床常见的有春季结膜炎、过敏性结膜炎、泡性结膜炎等。
　　针对春季结膜炎，可在急性期使用5-7天皮质类固醇眼液（每两小时1次，好转后迅速减量）、肥大细胞稳定剂（色甘酸钠）、抗组胺药（埃美丁）以及兼有肥大细胞稳定和抗组胺作用的帕坦洛滴眼液，经以上药物治疗仍有明显症状的顽固病例，可使用2%的环孢素滴眼液，往往可以很快控制症状，但在停药2～4个月后可有复发倾向。过敏性结膜炎除寻找并避免过敏原之外，局部眼部用药原则同春季结膜炎。泡性结膜炎的治疗主要使用皮质类固醇眼液。自身免疫性结膜炎的治疗采用免疫抑制剂如环孢素眼液和人工泪液，皮质类固醇药物使用需慎重，密切关注眼压及防止角膜溶解和穿孔。