【摘 要】
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目的建立一种以细菌染色体上1个已知拷贝管家基因作为基准、通过荧光定量PCR 检测其他被检基因拷贝数的方法。方法利用荧光定量PCR检测El Tor型霍乱弧菌染色体上目的基因zot
【机 构】
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室;
【基金项目】
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国家十五科技攻关计划课题资助(2003BA712A05-04)国家重大基础研究项目(973)课题(G1999054102)
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目的建立一种以细菌染色体上1个已知拷贝管家基因作为基准、通过荧光定量PCR 检测其他被检基因拷贝数的方法。方法利用荧光定量PCR检测El Tor型霍乱弧菌染色体上目的基因zot与基准基因thyA的Ct(threshold cycle)值差值,根据已知拷贝数菌株N16961的两基因Ct值之差来推算待测菌株中zot基因的拷贝数。结果利用thyA基因作参照,确定11株El Tor型霍乱弧菌中 zot基因的拷贝数在1-5个之间,对较少拷贝数的检测与Southern blot确认的相同,对多拷贝数检测优于Southern blot的判定。结论本方法可以准确检测菌株染色体上的基因拷贝数。
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