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采用18SrRNA对我国常见的4种三肠目涡虫的18SrDNA基因进行序列测定和分析，共获得三肠目2科3属4种的序列，同时结合GenBank中的三肠目18SrDNA序列（22条），以其姐妹群原序列目中的Archimonoceliscrw／fer为外群，采用MEGA3．0、PHYLIP、PAUP4．0等分子生物学软件分别构建NJ树、ME树、MP树和ML树，分析三肠目的系统发育关系。结果表明，不同构树方法所得系统树的拓扑结构基本一致。