利用生物信息学分析CALHM2在非小细胞肺癌中的表达及临床意义

来源 :医学临床研究 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zpe3werv
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
[目的]基于TCGA及GEO等数据库收录肿瘤高通量数据,分析钙稳态调节家族蛋白2(CAL-HM2)等CALHMs家族基因在非小细胞肺癌癌(NSCLC)中的表达及临床价值.[方法]利用Oncomine,GEPIA及UALCAN等在线工具分析和验证CALHMs(CALHM1-6)家族基因在NSCLC的表达水平;利用Human protein Atlas(HPA)分析CALHM2在NSCLC中的蛋白水平和定位;利用GEPIA和UALCAN分析CALHM2表达水平与NSCLC癌患者病理分期、淋巴结转移、p53突变和吸烟史的相关性;利用UALCAN分析CALHM2启动子甲基化水平;利用Kaplan-Meier Plotter分析CALHM2表达水平与NSCLC患者总生存期(OS),首次进展生存期(FP)及进展后生存期(PPS)的相关性;利用LinkedOmics分析NSCLC中与CAL-HM2表达的显著相关的基因,并利用Metascape进行GO功能富集.[结果]CALHM2在NSCLC组织中的表达水平显著下调;在NSCLC组织中CALHM2蛋白水平也显著降低.CALHM2表达水平与NSCLC患者病理分期、淋巴结转移、p53突变和吸烟史无显著相关性.Kaplan-Meier Plotter分析结果显示,CALHM2高表达的NSCLC患者的OS和FP均显著优于CALHM2低表达患者.LinckedOmics共筛查得到265个与CALHM2显著相关基因,且Metascape富集分析显示CALHM2相关基因显著富集于淋巴细胞活化和迁移,免疫激活相关过程、细胞因子释放调控等过程.[结论]在NSCLC中CALHM2表达显著下调,其可作为NSCLC患者预后的判断标志物.
其他文献
  目的 观察弥漫性轴索损伤(DAI)患者血清和脑脊液中神经元特异性烯醇化酶(NSE)的变化,探讨二者与损伤程度及预后的关系.方法 分别用放射免疫测定法检测79例DAI病人(实验组
会议
《巴黎协定》为人类有效抗击气候变化确立了机制和架构,但于中国来说则是一把双刃剑。经过各方艰苦谈判,巴黎气候变化大会在当地时间12月12日晚通过了旨在限制温室气体排放的
[目的]探讨干细胞标志物CD44、乙醛脱氢酶1(ALDH1)蛋白在宫颈癌组织中的表达及其临床意义.[方法]选取新疆维吾尔自治区人民医院病理科2018年1月至2019年12月宫颈癌组织标本78
进入21世纪,国家一批重大战略开始抓紧落地实施.建设与改革始终是重大战略实施的关键词.天下大事必作于细,再好的蓝图也需要踏踏实实仔仔细细落实才能成为现实.而在做好建设
期刊
  目的:为了解脑出血术后患者并发下呼吸道感染的特点及病原学情况,总结治疗经验,以便更好的指导临床用药,提高患者治愈率.方法:回顾性分析我院2012年4月~2013年3月-年间脑出
会议
作为招标采购领域从传统模式向数字化模式转型的重要载体,电子招标投标历经多年发展,越来越普遍地应用于工程建设项目、政府采购等诸多领域.在制度层面,随着《电子招标投标办
期刊
会议
笔者所在的公司为国有企业,是我国某通信运营企业集团的省级公司.公司设有专门的采购部,负责全省所有的采购业务.在采购部的业务中,有一些采购需求以年度为周期需进行重复性
期刊
请下载后查看,本文暂不支持在线获取查看简介。网漫乐园@黄子麟 Please download to view, this article does not support online access to view profile. Network Paradis
期刊