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创新驱动是我国当前发展的主要驱动力,农业科研事业单位作为我国的农业科技创新的主要力量,肩负着科技兴农的重要使命,国家对农业的投入不断加大.农业科研事业单位需要不断的提升管理水平和加强财务管理,充分发挥科研经费资金效益.本文通过对农业科研事业单位在部门预算管理工作中存在的一些重要问题进行探讨,以期提升农业科研事业单位部门预算工作执行质量,提高资金的使用效益.