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高攀龙论学特重格物，主张“学必由格物而入”。他痛感王学末流提倡“无善无恶”而带来的是非善恶混乱颠倒的学风世弊，重申程朱格物之旨，兼采阳明学致知之义，提出了独特的格物思想：强调客观面格知公是公非的标准，申明是非于天下；主观上将格物工夫落实于切己修身，由物格而知致，止于至善。其特点是明善而不著，格物以知本，认为致知必由格物而著实，一草一木之理亦所当格，意在折衷朱、王，去两短而合两长。