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探讨长链非编码RNA(lncRNA)小核仁RNA宿主基因3(SNHG3)在胃癌组织的表达及其临床意义。
方法利用癌症基因图集(TCGA)数据分析SNHG3在35例癌旁组织、56例Ⅰ期胃癌组织、123例Ⅱ期胃癌组织、169例Ⅲ期胃癌组织和41例Ⅳ期胃癌组织中的表达水平。利用Kaplan-Meier生存分析探讨SNHG3表达水平与胃癌患者的生存时间之间的关系。应用生物信息学手段分析SNHG3共表达基因影响的生物进程和信号通路。
结果lncRNA SNHG3在Ⅰ期胃癌(124.40±10.51，P＝0.034)、Ⅱ期胃癌(128.10±9.88，P＝0.003)、Ⅲ期胃癌(136.40±7.55，P＝0.000)和Ⅳ期胃癌(125.10±13.34，P＝0.004)中的表达水平均显著高于癌旁组织(67.16±8.19)，并且SNHG3表达量高的胃癌患者的生存时间较短。生物信息学预测显示SNHG3广泛参与RNA剪接、电子呼吸链的传递、mRNA加工、细胞外基质组织、细胞黏附、骨架系统开发、胶原蛋白分解代谢过程、脂肪酸代谢、剪接复合物、癌症通路、磷酸肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、RAP相关蛋白RAP-1A(Rap1)信号通路、Hippo信号通路等在内的多个生物学进程。
结论lncRNA SNHG3在胃癌组织中显著高表达，SNHG3表达量高的胃癌患者生存期短。