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两级管理制尚在探索,使得新建本科院校往往忽视院（系）在科研管理中的前沿地位及对教师进行科研激励的机制衔接,从而无法形成院校两级科研激励的最大合力。从院（系）细化和分解学校的激励政策、落实学校的激励导向、学校科研激励的薄弱环节主动出击三个方面探讨了二级单位与学校激励机制主动衔接的思路和方法。尽管院（系）的主动衔接在短期内形成了校院科研激励的合力,但要使这种合力发挥更持续有效的作用,还需要学校科研部门提供制度保障和良好的软环境。