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本文通过对剪形臂尾轮虫、矩形臂尾轮虫、十指臂尾轮虫、红臂尾轮虫、角突臂尾轮虫、双棘臂尾轮虫、裂足臂尾轮虫和萼花臂尾轮虫等八种臂尾轮虫rDNA ITS1序列分析，并以西氏晶囊轮虫为外群，使用PAUP和贝叶斯软件分别构建臂尾轮属轮虫系统发生树（MP树、NJ树、ML树和贝叶斯树），以探讨臂尾轮属的系统发生关系，并解决其中的一些分类问题。结果表明：本研究所涉及的轮虫rDNA ITS 1平均序列差异百分比较高，为29％；海水和淡水臂尾轮虫被明显分为不同的进化枝；除双棘臂尾轮虫外，在淡水臂尾轮虫中具有三对前棘刺且营附