【摘 要】
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目的对2011—2015年安阳地区手足口病(HFMD)相关柯萨奇病毒A6(CVA6)VP1基因进行研究，以了解本地区CV-A6的分子流行病学特征。方法使用实时荧光PCR方法对临床病例标本进行肠道病毒型别鉴定。设计引物对CV-A6阳性标本的VP1区进行扩增和测序。构建系统进化树并进行系统进化分析。对近年流行的CVA6中国毒株的VP1基因进行进化选择压力分析。结果2011—2015年安阳地区检出CV-
【机 构】
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455000 安阳市疾病预防控制中心微生物检验科,455000 安阳市疾病预防控制中心微生物检验科,455000 安阳市疾病预防控制中心微生物检验科,455000 安阳市疾病预防控制中心微生物检验科,
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目的对2011—2015年安阳地区手足口病(HFMD)相关柯萨奇病毒A6(CVA6)VP1基因进行研究，以了解本地区CV-A6的分子流行病学特征。
方法使用实时荧光PCR方法对临床病例标本进行肠道病毒型别鉴定。设计引物对CV-A6阳性标本的VP1区进行扩增和测序。构建系统进化树并进行系统进化分析。对近年流行的CVA6中国毒株的VP1基因进行进化选择压力分析。
结果2011—2015年安阳地区检出CV-A6阳性标本365份，占总肠道病毒阳性标本的比例为19.59%。系统进化分析显示，抽样调查的22条安阳地区CVA6 VP1序列中，有5条属于D1基因亚型，另外17条属于D2基因亚型。进化选择压力分析显示，D1、D2基因亚型中国株VP1基因承受的进化选择压力(ω值)分别为0.031和0.075；在D1、D2基因亚型中国株VP1基因上分别发现正选择氨基酸位点1处和4处。
结论2011—2015年安阳地区先后流行有D1、D2两种基因亚型的CVA6毒株。D2基因亚型对D1基因亚型的替代以及D2基因亚型的持续传播是造成安阳地区2013—2015年CV-A6型手足口病疫情的主要原因。
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