【摘 要】
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蒙古栎(Quercus mongolica)是我国北方阔叶树主要建群种,采用RNA-seq技术对蒙古栎叶片的转录组进行测序.通过Illumina测序平台共获得52 076 914条有效reads,从头组装共得到24
【机 构】
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潍坊学院生物与农业工程学院,山东潍坊261061;沈阳农业大学生物科学技术学院,沈阳110866
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蒙古栎(Quercus mongolica)是我国北方阔叶树主要建群种,采用RNA-seq技术对蒙古栎叶片的转录组进行测序.通过Illumina测序平台共获得52 076 914条有效reads,从头组装共得到24 196个UniGene,平均长度为732 bp.根据GO功能注释,共有17 561个UniGene可以注释到分别对应于细胞组分、分子功能、生物学过程的674、1 909、2 842个GO term.KEGG富集分析表明,9 189个UniGene被富集到138条代谢途径,主要包括植物-病原体相互作用、剪接体、内吞、内质网蛋白质加工、植物激素信号转导等.根据eggNOG分类注释结果,19 378个UniGene富集到25个功能类别中.NCBI_nr库注释结果表明,蒙古栎与核桃(Juglans regia)之间可能存在较近的亲缘关系.研究结果扩充了蒙古栎的基因资源,为进一步挖掘蒙古栎的功能基因信息提供了理论基础.
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