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新型农村合作医疗制度是惠民利民的国策，呈现出良好的发展趋势。但是，从医院视角分析新型农村合作医疗的报销制度，仍然存在着政策、报销比例及软件系统的不统一而加大了医院的工作量；基本药物目录、诊疗项目目录调整的不合理，限制了医院新业务、新技术发展和患者享受创新技术的渴望。因此，建议加强政策的稳定性、报销制度的统一性、基本药物及诊疗项目的合理性以及信息系统的兼容性。