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为揭示不同发酵菌种处理对中草药酵素品质及抑菌效果的影响，本试验采用自然发酵、乳酸菌发酵、酵母菌发酵、乳酸菌和酵母菌混菌发酵4种方法制备金银花、蒲公英、野菊花酵素，通过感官评价和1,1-二苯基-2-三硝基苯肼（DPPH）自由基、2,2-联氮-二（3-乙基-苯并噻唑-6-磺酸）二铵盐（ABTS+）清除率考查所得酵素产品品质，并检测其对大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌和沙门菌的抑制效果。结果显示：3种添加发酵菌种制备的酵素产品感官品质和DPPH自由基、ABTS+清除率及抑菌效果均高于自然发酵制备的酵素；其中采用乳酸菌发酵制备的中草药酵素产品品质最好，其呈棕红色、鲜亮，有淡淡的酸甜味，口感润滑且后味香醇，与自然发酵产品比，对DPPH自由基、ABTS+清除率分别提高了36.74%、34.02%,差异显著（P＜0.05）,对大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌和沙门菌的抑菌圈直径分别增加了65.84%、92.80%和148.94%,差异显著（P＜0.05）。结果表明：添加0.1 g乳酸菌于37℃发酵15 d制备的金银花、蒲公英、野菊花中草药酵素产品品质最好，且大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌和沙门菌对1.0 g/mL的乳酸发酵酵素稀释液表现出极度敏感性。