选取云南两种具有代表性的地方优质鸡种盐津乌骨鸡和武定鸡为研究对象,采用双向电泳(2DE)分析其腿肌与胸肌中蛋白表达差异,并以基质辅助激光解析电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF MS)鉴定腿肌与胸肌中差异蛋白质点。结果表明,经双向电泳图谱分析所获得的肌肉组织蛋白点分布于pH4.0～7.0之间,其中盐津乌骨鸡腿肌、胸肌中分别检测到(1421±34)、(1329±25)个蛋白点;武定鸡腿肌、胸肌中检测到(1585±19)、(1516±28)个蛋白质点。对比分析盐津乌骨鸡与武定鸡的DE图谱,发现有178个点存在明显的表达差异,在盐津乌骨鸡中高表达的点有72个,在武定鸡中高表达的点有106个。选取的蛋白质点经鉴定主要为核纤层蛋白A、磷酸葡萄糖变位酶1、β-烯醇酶、原肌球蛋白1、三磷酸腺苷合成酶、C-反应蛋白前体、B链α-晶状体蛋白、肌酸激酶M型、乙二醛酶1、磷酸甘油酸激酶PGK1、慢骨肌肌钙蛋白T、蛋白酶体非ATP酶调节亚单位14、热休克蛋白β-1超氧化物歧化酶、以及一些假设蛋白和非特征性蛋白。