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利用SSR标记分析了疣粒野生稻同栽培稻IR24间的遗传多样性，并对引物扩增条带类型进行了比较分析。结果表明，在所用的159对引物中共有153对引物检测到多态性位点，占总引物数的96．8％。在2个材料中共有848个位点扩增出条带，其中扩增条带片段大小相同的有67条，占总带数的7．9％。引物扩增多态性条带可以分为扩增条带片段大小不同、扩增条带数目不同和扩增条带强弱不同3种类型。说明在栽培稻中开发的SSR标记在疣粒野生稻中发生了很大的变异，不适宜进行遗传多样性分析，但仍可以应用于疣粒野生稻进行分子标记辅助选择。