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基于FPGA的协方差矩阵运算的实现大多采用的是定点计算方式,在运算过程中,存在数据处理动态范围小,容易溢出,截断误差等问题。加之以空间谱估计为研究背景的协方差矩阵运算,大多得到的是针对特殊阵列模型的实对称矩阵,不具备通用性。针对定点运算的不足和该运算的适用范围,研究了浮点运算和复数运算的特点,提出了基于复数矢量的浮点协方差运算的FPGA实现方案。在Altera／stratix／EP1S20F780C7中的仿真和调试结果表明了该方案的有效性。