青藏高原分布着我国最密集的极端环境湖泊群,湖泊类型和水化学特征多样,而不同类型湖泊的细菌群落组成与多样性差异的系统研究相对较少。本文以青藏高原4类典型水化学特征湖泊（即氯化物型、Mg SO4亚型、Na2SO4亚型、碳酸盐型）为研究对象,借助Illumina测序16S rRNA基因（V3-V4区）分析细菌多样性、群落组成差异及其优势属与环境因素的制约关系。结果表明:MgSO4亚型与氯化物型湖泊多属于超盐环境,而大多数Na2SO4亚型与碳酸盐型湖泊属于咸水、微咸水或淡水环境。4类湖泊获得分类地位明确的细菌共计45门81纲1,148属（52,031个OTUs）,细菌Shannon指数为碳酸盐型（5.27±0.57）＞ Na2SO4亚型（4.96±0.51）＞氯化物型（4.12±0.80）＞ MgSO4亚型（3.64±1.04）。优势细菌门是变形菌门、厚壁菌门和拟杆菌门。变形菌门的相对多度总体较高,优势纲是γ-、α-和β-变形菌纲;厚壁菌门多分布于Mg SO4亚型和氯化物型湖泊,优势纲是芽孢杆菌纲;拟杆菌门主要分布于碳酸盐型和Na2SO4亚型湖泊,优势纲是黄杆菌纲。全部氯化物型和少数Mg SO4亚型湖泊的细菌组成相似,优势属是假单胞菌属（Pseudomonas）、乳球菌属（Lactococcus）和不动杆菌属（Acinetobacter）,其聚集分布与总盐度、主要离子(Mg2+、Cl–、Na+与K+)和温度相关;Mg SO4亚型湖泊独有的常见属是芽孢杆菌属（Bacillus）、气单胞菌属（Aeromonas）、大洋芽孢杆菌属（Oceanobacillus）等,其聚集分布与SO42–浓度正相关;Na2SO4亚型与碳酸盐型湖泊的细菌组成相似,优势属是水弯曲菌属（Aquiflexum）、海仙菌属（Haliea）与苍黄杆菌属（Luteolibacter）,其聚集分布与HCO3–浓度、pH值和海拔高度呈显著正相关。与世界上其他湖泊组/群相比,青藏高原湖泊具有独特的细菌优势属和常见属,不同类型湖泊的细菌群落组成存在显著差异,可能与水化学类型或地理位置有关。