番木瓜酸性转化酶基因家族预测及生物信息学初步分析

来源 :基因组学与应用生物学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tyhz3030
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
酸性转化酶参与了番木瓜果实中蔗糖的韧皮部卸载,调控果实中糖类的积累。本文利用番木瓜基因组数据库信息,发现了番木瓜基因组中含有6个酸性转化酶基因,分别为细胞壁转化酶基因(CpCWINV1-3)和液泡转化酶基因(CpVINV1-3)。这些基因由3~7个外显子组成,其中CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2的N端均具有一个跨膜区域。蛋白质3D结构预测分析表明,CpCWINV1、CpVINV1和CpVINV2具有典型的N端β-螺旋桨模块(β-propeller module)和C端β-三明治模块(β-sandwich module),而CpCWINV3和CpVINV3的桨叶I上,均没有保守区NDPNG/A;CpCWINV2和CpVINV3均缺失了β-三明治模块。推测番木瓜细胞壁转化酶CpCWINV1、液泡转化酶CpVINV1和CpVINV2能正确履行催化蔗糖分解的功能。本研究有助于我们进一步揭示酸性转化酶在番木瓜果实发育及糖类积累过程中的作用。 Acid invertase participates in the unloading of phloem in papaya fruits and regulates the accumulation of sugars in fruits. In this paper, papaya genome database information found in the papaya genome contains six acid invertase gene, respectively, the cell wall invertase gene (CpCWINV1-3) ​​and the vacuolar invertase gene (CpVINV1-3). These genes consist of 3 to 7 exons, of which CpCWINV1, CpVINV1 and CpVINV2 each have a transmembrane region at the N-terminus. Prediction of protein 3D structure showed that CpCWINV1, CpVINV1 and CpVINV2 have typical β-propeller module and β-sandwich module, while CpCWINV3 and CpVINV3 have a , There is no conserved region NDPNG / A; CpCWINV2 and CpVINV3 are missing β-sandwich module. It is speculated that papaya cell wall invertase CpCWINV1, vacuolar invertases CpVINV1 and CpVINV2 can correctly perform the function of catalyzing sucrose decomposition. This study will help us further reveal the role of acid invertase in the development of papaya fruit and carbohydrate accumulation.
其他文献
虾青素是一种类胡萝卜素色素,具有刺激免疫、防止癌变、消除自由基、抗氧化、保护生物膜及防止心血管疾病等特殊的生理功能,目前在食品、饲料、化妆品及医药行业的应用越来越受到人们的重视。本论文以产虾青素的法夫酵母作为研究对象,从生物反应过程工程的角度着手,对法夫酵母的反应器分批发酵过程进行了详细研究。通过对不同KLa及恒溶氧条件下法夫酵母分批发酵过程的研究及动力学分析,提出了四种不同的分段KLa控制策略。
影响铅酸蓄电池寿命的因素是多方面的,包括电池的内在因素,如蓄电池的结构、正负极板栅材料、正负极活性物质、隔板、电解液浓度等,也取决于一系列的外在因素,如放电电流密度、温
  编码微球在多指标检测系统中起着至关重要的作用。传统编码技术将各种编码物质纳入单一颗粒,因此可控性较差且编码过程复杂。本文报道一种全新的编码策略,主要基于主/客体
  Purpose.The use of phosphenes evoked by transcorneal electrical stimulation(TcES)has been proposed as a means of residual visual function evaluationand cand
会议
为充分利用非粮农作物—芭蕉芋淀粉的直链淀粉含量高和分子量大等特性和优势,本课题旨在探索其作为淀粉基复合材料原料的方法及其可行性,以丰富其综合利用的方式和向高附加值方向转换的方法。本课题是以高直链淀粉含量的芭蕉芋作为原料,经过一定的酯化改性后制备成醋酸酯/聚乙烯醇(SA/PVA)复合膜材料。通过FT-IR、XRD、SEM等对酯化改性淀粉和SA/PVA复合膜进行结构表征,并对不同酯化改性淀粉的黏度、冻
  The 2D janus hybrid(gold NPs/graphene)superstructures were built via arapid,solventless sputtering method in 10 seconds.The size and morphology of gold NPs
会议
ABA作为一种重要的植物激素和生长调节剂,介导了高等植物在生命周期中对各种外界环境的响应和适应。9-顺式环氧类胡萝卜素双加氧酶(9-cis-epoxycarotenoi d dioxygenase,NCED
目前,针对创伤、手术切除等引起的大段骨缺损,迫切需要制备出新型的三维多孔骨支架材料。作为植入人体的良好的骨修复材料,不仅不能对人体各系统产生不良影响,还需能够促进周
  A SDG-based simulation procedure is proposed in this study to qualitatively predict the effects of one or more fault propagating in a given process system.
会议
  The collective behavior of certain animals and insects has the characteristic of self-organization.The simple interactions among individuals can produce com
会议