【摘 要】
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通过对副溶血弧菌噬菌体VPp1全基因组分析,利用相似性比对数据库BLAST和序列模体数据库,初步推定该基因组的ORF31编码内溶素,预测该开放式阅读框编码一种糖苷水解酶。预测内
【机 构】
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中国海洋大学食品科学与工程学院,青岛市食品药品检验研究院,青岛市城市排水监测站
【基金项目】
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海洋水产食品加工技术研发与产业化示范（2012BAD28805）,现代农业产业体系（CARS-50）
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通过对副溶血弧菌噬菌体VPp1全基因组分析,利用相似性比对数据库BLAST和序列模体数据库,初步推定该基因组的ORF31编码内溶素,预测该开放式阅读框编码一种糖苷水解酶。预测内溶素不含信号肽、跨膜区域。从生物信息学角度推定噬菌体VPp1内溶素的裂解机制可能是联合孔蛋白协同作用裂解细菌肽聚糖。本研究为进一步揭示内溶素生物学特性提供基础数据。
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