【摘 要】
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目的 探索检测细胞内RNA loop存在的实验方法.方法 活细胞状态下交联蛋白核酸复合物、RNA免疫沉淀后在RNA不同位置设计引物,通过定量PCR结果间接检测RNA loop;另外,活细胞状
【机 构】
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汕头大学医学院组织学与胚胎学教研室 广东省汕头市,515041汕头大学医学院细胞生物学教研室 广东省汕头市,515041;
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目的 探索检测细胞内RNA loop存在的实验方法.方法 活细胞状态下交联蛋白核酸复合物、RNA免疫沉淀后在RNA不同位置设计引物,通过定量PCR结果间接检测RNA loop;另外,活细胞状态下交联蛋白核酸复合物后超声断裂核酸片段,相邻断端RNA连接后通过反向PCR的方法直接检测活细胞内RNA loop.结果 RNA结合蛋白在RNA的5′端和3′端结合水平高而中间段低,提示有可能存在RNA loop.反向PCR扩增测序获得远距离RNA片段的相连直接证实RNA loop的存在.结论 活细胞状态下交联蛋白核酸复合物然后检测RNA loop的技术,期望能为研究的RNA的高级结构和功能提供新的方法.
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