【摘 要】
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目的 了解衢州市鼠类携带莱姆病螺旋体状况以及莱姆病螺旋体基因型.方法 采用针对莱姆病螺旋体5S～23S基因间隔区的巢式PCR方法检测鼠脾标本,对阳性样本进行基因测序及分析,构建系统发育树.结果 在378份鼠标本中检出菜姆病螺旋体核酸阳性57份,阳性率15.08％.有Borrelia garinii (B.g)基因型、Borrelia valaisiana(B.v)基因型Bor-relia spielmanii(B.sp)基因型.结论 衢州境内鼠类存在至少3个型别莱姆病螺旋体感染,应加强该病原体的检测和莱姆
【机 构】
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浙江省衢州市疾病预防控制中心,衢州 324000
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目的 了解衢州市鼠类携带莱姆病螺旋体状况以及莱姆病螺旋体基因型.方法 采用针对莱姆病螺旋体5S～23S基因间隔区的巢式PCR方法检测鼠脾标本,对阳性样本进行基因测序及分析,构建系统发育树.结果 在378份鼠标本中检出菜姆病螺旋体核酸阳性57份,阳性率15.08％.有Borrelia garinii (B.g)基因型、Borrelia valaisiana(B.v)基因型Bor-relia spielmanii(B.sp)基因型.结论 衢州境内鼠类存在至少3个型别莱姆病螺旋体感染,应加强该病原体的检测和莱姆病的防制.
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目的 对珠海市4例不同时期新型冠状肺炎确证病例的呼吸道标本进行三代测序,获得新型冠状病毒全基因组序列,分析基因组突变及分子溯源情况.方法 采用nanopore三代高通量测序技术对呼吸道标本中的新型冠状病毒基因组测序,基于artic流程组装病毒基因组序列,运用生物信息学软件分析病毒全基因组序列与参考序列的一致性与进化情况.结果 4份样本均可获得28298～29819 bp长度的基因组序列数,基因组覆盖度94.6％～99.7％,共检出46个碱基位点突变、涉及27处氨基酸变异,非同义突变占比58.7％(27/4
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