【摘 要】
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为克隆并分析湖南衡阳分离的犬瘟热病毒(CDV)HuN-HY171124毒株H基因,采用逆转录反应合成第一链cDNA,利用巢式PCR扩增H基因全长,将PCR产物纯化克隆至T载体中构建重组载体pMD19
【机 构】
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衡阳师范学院生命科学与环境学院,衡阳师范学院畜禽养殖生物工程技术研究所,生物资源保护与利用衡阳市重点实验室,湖南衡阳421008;
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为克隆并分析湖南衡阳分离的犬瘟热病毒(CDV)HuN-HY171124毒株H基因,采用逆转录反应合成第一链cDNA,利用巢式PCR扩增H基因全长,将PCR产物纯化克隆至T载体中构建重组载体pMD19-T-CDV-HuN-HY171124-H,经序列测定,利用DNAStar和Mega等生物信息学软件进行序列分析.结果 显示,CDV HuN-HY171124毒株H基因开放阅读框(ORF)为1824 bp,编码607aa.相似性比对结果显示,该毒株与GenBank中58株分离毒株的核苷酸相似性在90.4％～98.8％之间,与弱毒疫苗毒株核苷酸的相似性均在90％左右,与我国分离的强毒株核苷酸的相似性均在98％左右.CDV HuN-HY171124毒株H蛋白第519氨基酸氨基酸为精氨酸、第549氨基酸氨基酸为酪氨酸,均为犬源CDV H蛋白特征性氨基酸.遗传进化分析发现该毒株与我国分离的大部分毒株均属于与我国分离的大部分毒株属于Asia 1型,与现有疫苗毒株不处同一个分支.CDV HuN-HY171124毒株是一株犬源CDV,其基因型属于Asia-1型,本研究扩充了CDV区域性流行病学基础数据.
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