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目的对荧光定量PCR检测肝病患者血清HBV-DNA的进行对比分析。方法选取2008年12月-2012年12月我院收治的肝病患者肝病患者126例，依据患者情况分为两组患者，甲组患者62例，患者为病毒性肝炎患者；乙组患者64例，为非病毒性肝炎患者，均采用荧光定量PCR检测肝病患者血清HBV-DNA。结果乙组患者的血清HBV-DNA含量显著低于乙组患者，差异性显著，具有统计学意义（P<0.05）。乙组患者HBeAg阳性率显著低于甲组患者，差异性显著，具有统计学意义（P<0.05）。结论采用荧光定量PCR检测肝病患者血清HBV-DNA，可更加明确的反应出人机体内病毒增加复制的情况，同时更加直接的反应患者所携带病毒量水平。