【摘 要】
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采用密度泛函理论,将基于能量的分子片方法（GEBF）应用于气相中优化B型脱氧核糖核酸（碱基对数目N=2,5,10）双螺旋构型的结构。通过比较M06-2X泛函和其他方法（B3LYP、B3LYP-vdW和TPSS
【机 构】
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江苏第二师范学院生命科学与化学化工学院,东华理工大学软件学院
【基金项目】
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江苏省自然科学基金（BK20130748）,江苏省高校自然科学研究项目（13KJB150012）,江西省自然科学基金（20142BAB2130IO）和国家自然科学基金（21405013）资助项目
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采用密度泛函理论,将基于能量的分子片方法（GEBF）应用于气相中优化B型脱氧核糖核酸（碱基对数目N=2,5,10）双螺旋构型的结构。通过比较M06-2X泛函和其他方法（B3LYP、B3LYP-vdW和TPSS泛函）的结果,发现不考虑碱基之间的π-π堆积作用将会导致碱基之间的纵向距离拉长。随着体系双螺旋链长的增加,没有考虑碱基堆积作用而导致的相邻碱基纵向距离拉长的程度快速衰减。计算表明,气相中B-DNA双螺旋结构的稳定性来源于其作用力（主要是氢键和π-π堆积作用）的协同性,对不多于10组碱基对的体系而言,其
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