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目的:分析影响医保制度运行的影响因素。方法:采用分层整群抽样的方法进行问卷调查,采用多因素Logistic回归进行数据分析。结果:医保制度运行的主要影响因素为转诊制度的设计(OR=1.638)、基金使用问题(OR=1.347)、患者经济负担(OR=1.424)、流动人口异地就医(OR=1.349)以及试点地区整合程度(OR=1.327)。结论:现行医保制度运行问题较为严重,应从医保制度设计、对基金和机构的监督管理、医保制度整合等多层面进行调整,提高医保制度运行效果。