先天原因
　　生物学研究表明，在胚胎期，人的性腺结构在发育初期倾向于形成女性器官卵巢，心理学家曼内称之为“夏娃原理”。如果缺乏雄性激素，胎儿在母体内就会引起男性大脑女性化，从而造成性别认同的困难。
　　
　　后天原因
　　人的性别认同是通过对自我性别体象的理解，对神经内分泌和排尿等生理活动机制的初步明确，以及通过父母的示范作用、社会的强化作用和语言的影响等得以发展的。很多家长认为，性别认知是件自然不过的事，随着年龄的增长，孩子会顺理成章地完成性别认同，确定自己的性别角色。其实，除了先天原因的影响，一个孩子最终确认自己是男孩还是女孩，主要是在外界环境和教育等因素的渗透下缓慢进行的。如果外界没有给予孩子正确的导向，孩子就有可能产生性别角色混淆。
　　
　　孩子产生性别错位的3种家庭高危区
　　
　　单亲家庭及其辐射区
　　单亲家庭里缺乏母亲的温柔细心或是父亲的果断自信，难以给孩子一个完整和谐的成长环境，长时间和同一性别成人生活的孩子比较容易偏离正确的性别角色，而很多家长对这种缺憾的影响却浑然不觉，等发现孩子的性别认同存在问题时，孩子已经偏离正常轨道很远了。
　　常见的还有由于父母一方工作繁忙，无法照顾孩子的家庭。
　　
　　不和睦家庭
　　心理学家调查发现，成长于不和睦家庭的孩子性格往往存在不同程度的缺陷，要么叛逆偏激，要么固执怪异。这类孩子在家庭的压力下无法正确完成性别认同，可能会把投射在父母身上的反感，转化为对某种性别的偏差态度。
　　
　　家长误导家庭
　　比如，有的家长出于对女孩的偏爱或其他原因，将自己家的男孩“装扮”成女孩模样，（或反之）……长期“异性打扮”，会导致孩子产生性别认同混淆。尤其当孩子成长到了青春期，第二性征陆续出现时，心理上更容易产生困扰。
　　
　　影响孩子性别错位的其他因素
　　
　　学校：
　　在最初的受教育阶段，孩子接触的“施道者”基本上都是女性，幼儿园的“男阿姨”自然是凤毛麟角，甚至在国内大多数城市的中小学校，教师性别生态失衡的问题也日渐凸显。男教师的一些性格和生理特点，是女教师不可替代的。学校男教师少，就如同缺少父爱的“单亲家庭”，容易使孩子的心理、思维出现缺陷。而且多数学校还要求孩子循规蹈矩，把女生的行为视为榜样，并以此为标准来衡量男生。
　　
　　社会：
　　由于社会竞争激烈，为了增加生存的砝码，很多女性被教育得越来越“强势”。家长目睹升学以及就业等方面的残酷竞争，因此提早给孩子打“预防针”，处处以男孩的标准要求女孩。另一方面，很多独生子女受到家长特别是祖辈全方面的呵护，在这样的环境下，男孩容易养成文弱、多愁善感等不像男子汉的习气。