【摘 要】
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基于网络药理学和动物实验研究桔梗抗肺纤维化的作用机制.通过TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库预测桔梗的成分和作用靶点,并与通过GeneCards、OMIM、Disgenet、Drugbank数据库筛选出的肺纤维化的疾病靶点交集整合,获得桔梗治疗肺纤维化的潜在靶点.运用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”的网络图和潜在靶点的相互作用关系,并联合String平台绘制PPI网络,同时进行拓扑学分析,基于R软件使用Bioconductor生物信息软件包对交集靶点进行
【机 构】
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南京中医药大学中医儿科学研究所,江苏省儿童呼吸疾病(中医药)重点实验室,江苏南京210023;南京中医药大学中医儿科学研究所,江苏省儿童呼吸疾病(中医药)重点实验室,江苏南京210023;江苏省中药高
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基于网络药理学和动物实验研究桔梗抗肺纤维化的作用机制.通过TCMSP、Swiss Target Prediction等数据库预测桔梗的成分和作用靶点,并与通过GeneCards、OMIM、Disgenet、Drugbank数据库筛选出的肺纤维化的疾病靶点交集整合,获得桔梗治疗肺纤维化的潜在靶点.运用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”的网络图和潜在靶点的相互作用关系,并联合String平台绘制PPI网络,同时进行拓扑学分析,基于R软件使用Bioconductor生物信息软件包对交集靶点进行GO和KEGG富集分析预测作用机制.采用动物实验对网络药理学分析结果进行验证,构建肺纤维化小鼠模型,进行病理染色、ELISA检测、肺功能检测、qRT-PCR及Western blot.桔梗8个潜在活性成分对应289个靶点,肺纤维化1129个疾病靶点,得到药物-疾病共同靶点65个,GO富集分析共得到条目1575个,KEGG富集分析得到146个条目,涉及磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17 (IL-17)信号通路等.动物实验结果表明,桔梗能改善肺纤维化小鼠的肺部炎症及胶原沉积.Western blot结果显示,桔梗治疗肺纤维化小鼠后,PI3K-AKT信号通路相关蛋白p-PI3K、p-AKT表达呈剂量依赖性下调,p-AKT的下调抑制了P21的表达,提示桔梗可能通过调控PI3K-AKT通路相关蛋白表达影响细胞衰老治疗肺纤维化小鼠.本文运用网络药理学揭示了桔梗抗肺纤维化的作用靶点和通路并进行了相关验证,为深入探讨桔梗抗肺纤维化的作用机制提供了依据.
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