新疆兵团肠道病毒71型和柯萨奇病毒16型的基因亲缘关系分析

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目的分析新疆兵团2014年引起手足病(HFMD)的肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(Cox A16)的基因亲缘关系。方法采用RT-PCR扩增标本中的EV71和Cox A16 VP1编码区的基因,进行测序及序列分析。根据VP1区与Gen Bank的某些代表株序列构建基因亲缘关系树。结果 EV71的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为94.5%~99.9%和98.3%~100.0%,Cox A16的则为92.0%~99.8%和98.6%~100.0%;在系统进化树中,EV71和Cox A16分别为C4a和B1b基因亚型。结论新疆兵团流行的EV71株和Cox A16分别仅有C4a和B1b一个进化分支在循环,与国内其他地区HFMD病原学及分子进化研究结果一致。
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