【摘 要】
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【背景】球囊菌是一种典型的蜜蜂真菌性病原,特异性地侵染蜜蜂幼虫。目前,有关球囊菌在侵染过程中的基因表达规律的信息极为有限。【目的】通过深入分析胁迫意大利蜜蜂（意蜂）幼虫肠道的球囊菌及其纯培养的高表达基因（HEGs）差异,探索球囊菌在胁迫意蜂幼虫肠道后期与胁迫前的基因表达规律。【方法】利用RNA-Seq技术对球囊菌胁迫的意蜂6日龄幼虫肠道（Aam T）及球囊菌纯培养（AaCK）进行深度测序,根据FP
【基金项目】
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现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-44-KXJ7）； 福建农林大学科技发展基金（KF2015123）； 国家级大学生创新创业项目（201610389016）～～；
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【背景】球囊菌是一种典型的蜜蜂真菌性病原,特异性地侵染蜜蜂幼虫。目前,有关球囊菌在侵染过程中的基因表达规律的信息极为有限。【目的】通过深入分析胁迫意大利蜜蜂（意蜂）幼虫肠道的球囊菌及其纯培养的高表达基因（HEGs）差异,探索球囊菌在胁迫意蜂幼虫肠道后期与胁迫前的基因表达规律。【方法】利用RNA-Seq技术对球囊菌胁迫的意蜂6日龄幼虫肠道（Aam T）及球囊菌纯培养（AaCK）进行深度测序,根据FPKM值筛选得到球囊菌的HEGs,进而通过GO（Gene ontology）及KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）富集分析、Venn分析对上述HEGs进行功能预测和生物学意义挖掘。【结果】AaCK与Aam T的转录组测序共得到105 447 578条原始读段（Raw reads）,经过滤得到88 466 344条有效读段（Clean reads）,两端平均Q20为97.50%,平均Q30为93.81%。GO富集分析结果显示,AaCK的HEGs富集于26个GO terms,基因富集数最多的是细胞（22 Unigenes）,其次是细胞组件（22 Unigenes）和代谢过程（21 Unigenes）;Aam T的HEGs富集于22个GO terms,基因富集数最多的是催化活性（23 Unigenes）,其次是细胞进程（18 Unigenes）和代谢过程（18 Unigenes）。KEGG代谢通路（Pathway）富集分析显示,AaCK的HEGs富集在109个Pathways上,基因富集数最多的是核糖体（179 Unigenes）,其次是氨基酸生物合成（70Unigenes）和碳代谢（62 Unigenes）;Aam T的HEGs富集在114个Pathways上,基因富集数量最多的是核糖体（178 Unigenes）,其次是碳代谢（116 Unigenes）和氧化磷酸化（112 Unigenes）。Venn分析结果显示,AaCK与Aam T共有的HEGs有260个,二者特有的HEGs分别为2 161个和4 445个。【结论】提供了胁迫意蜂6日龄幼虫肠道的球囊菌及其纯培养的HEGs表达谱,揭示了球囊菌在胁迫前和胁迫后期的基因表达规律,也为阐明球囊菌致病的分子机理提供了有益的信息和线索。
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