为探明中国育成的紫心甘薯品种之间的遗传多样性和遗传差异，本研究利用124对SSR引物对搜集到的76个紫心甘薯品种进行遗传多样性分析。通过6%的聚丙烯酰胺凝胶电泳获得76个品种的PCR扩增条带数据，构建0～1数据矩阵，利用NTSYS2.10e软件计算Nei’s遗传距离，将遗传距离系数矩阵导入MEGA7.0.26，进行遗传距离分析和NJ聚类分析；利用STRUCTURE 2.3.4软件进行群体结构分析。结果表明：124对引物共扩增出750条条带，其中多态性条带为90.13%，每对引物检测出2～18个等位变异，平均6.05个；76个紫心甘薯品种的遗传距离在0.044 2～0.601 0之间，平均为0.292 1，进一步分析发现，国内各薯区品种间的遗传距离较近，外引品种绫紫与国内各薯区品种间的遗传距离较远，因此可以通过引进国外紫薯品种来扩大国内紫心甘薯的遗传背景；在遗传距离0.261 3处可分为3个族群，在0.225 3处可分为9个族群，在0.217 3处将第Ⅸ族群划分为4个亚群，来源地相近或拥有相同亲本的紫心甘薯材料有聚在一起的趋势；通过对群体结构K值分析，发现76份品种划分为3个稳定的群体，最大Q值分析发现，最大Q值越大群体的遗传背景就越简单，最大Q值<0.6时，品种的遗传成分来源于不同群体，群体间存在明显的基因交流，76个紫心甘薯品种遗传成分有三个变异来源。