基于生物信息学研究肝癌脂肪酸代谢lncRNA预后免疫反应及药物敏感性分析

来源 :中国免疫学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:epwangke96
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目的:探究HCC脂肪酸代谢相关的预后lncRNA,并对免疫反应以及药物敏感性进行分析。方法:采用生物信息学获取TCGA数据库的HCC基因数据,筛选出最具预后特征的lncRNA并构建预后模型;利用ROC曲线、列线图验证模型准确性;再利用GO、KEGG对lncRNA进行生物学分析;然后,采用GSVA、TMB对HCC患者的免疫状态与突变基因进行分析;最后,利用TIDE评分对HCC患者的免疫治疗获益情况进行分析,以确定对HCC潜在有效的药物。结果:①确定了4个与脂肪酸代谢相关的lncRNA(AC074117.1、TMCC1-AS1、LINC01063、MKLN1-AS);②K-M曲线、ROC曲线证实了分期、风险评分可以评估HCC患者的预后;③列线图等证实了模型预测的准确性;④GO和KEGG分析证实了脂肪酸代谢相关lncRNA丰富的生物学功能;⑤GSVA分析显示浆细胞、B细胞、中性粒细胞、NK细胞与II型-IFN反应在两组风险人群中存在明显差异,TMB分析则显示低TMB低风险组的患者预后最好;⑥TIDE评分显示高风险组的TIDE评分明显高于低风险组,并筛选出了更适合高风险人群的5种抗癌药,分别是环巴胺、雷帕霉素、Proteasome抑制剂、紫杉醇、舒尼替尼。结论:4个脂肪酸代谢相关的lncRNA构建的预测模型有助于评估HCC患者的预后,并可能为HCC患者的临床应用以及免疫治疗提供见解。
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