在全球生物多样性治理不断深入的背景下，日本与东盟的合作已有二十多年历史。“日本-东盟环境合作对话”机制建立后，双方的生物多样性合作进程明显加快，内容不断丰富，已由传统生态保护向环境可持续城市建设、海洋生物多样性保护、低碳社会构建、能力培养等领域拓展。日本凭借经济与技术优势，主导合作议程和项目制定，通过能力建设项目传播本国的理念，塑造东盟国家的认知，使东盟逐渐对日本产生“治理依赖”。日本与东盟的生物多样性合作无法掩盖日本的地缘利益诉求，合作中存在明显的不对等关系。后疫情时代，双方的合作将继续落实2030年可持续发展目标的要求，优先推动脱碳社会的构建，并受到“2020年后生物多样性框架”的影响，双方的不对等关系将继续加强。近年来，我国积极推进与东盟国家的生物多样性保护与合作，应注重项目落实、关注经济发展、创新合作内容、强调“绿色发展”叙事，进而提升中国在全球生物多样性治理中的话语权。