【摘 要】
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背景:在牙周重建组织工程学中,包含基因众多且无法通过生物实验逐一验证.借助生物信息学手段,整合分析相关基因,构建牙周重建相关的级联调控通路,从而找到开启牙周重建的关键基因.目的:文章以分析牙周重建生物过程和调节机制为着眼点,旨在筛选出牙周重建过程中关键性的启动基因,为牙周重建治疗寻找理想的基因靶点.方法:①采用GO功能注释体系,对参与牙周重建的干细胞分化、骨组织改建以及牙周软组织形成功能的基因做整合分析,找出各功能交集基因;②集成TRANSFAC、TarBase、TransmiR、miRTarBase及m
【机 构】
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哈尔滨市儿童医院,黑龙江省哈尔滨市150010;哈尔滨市口腔医院,黑龙江省哈尔滨市150016;哈尔滨市儿童医院,黑龙江省哈尔滨市150010;哈尔滨市口腔医院,黑龙江省哈尔滨市150016
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背景:在牙周重建组织工程学中,包含基因众多且无法通过生物实验逐一验证.借助生物信息学手段,整合分析相关基因,构建牙周重建相关的级联调控通路,从而找到开启牙周重建的关键基因.目的:文章以分析牙周重建生物过程和调节机制为着眼点,旨在筛选出牙周重建过程中关键性的启动基因,为牙周重建治疗寻找理想的基因靶点.方法:①采用GO功能注释体系,对参与牙周重建的干细胞分化、骨组织改建以及牙周软组织形成功能的基因做整合分析,找出各功能交集基因;②集成TRANSFAC、TarBase、TransmiR、miRTarBase及miRecords数据库,建立“牙周重建相关的级联调控通路”,将牙周重建生物学过程内的所有基因映射到调控网络内,用广度优先算法将这一子网内的所有线性通路挖掘出来,找出调控上游基因.结果 与结论:①干细胞分化、成骨细胞分化/成骨细胞增殖以及成纤维细胞增殖3种生物功能的交集基因是CDK6和SFRP1;②级联调控通路中,可以作为上游调控牙周重建的关键基因有3个一级基因:骨形态发生蛋白7、PAX2和SMAD3,有2个二级基因:RUNX2和JUN,有2个3级基因:ESR1和GNAS;上游起始基因多包含在成骨细胞分化/成骨细胞增殖功能过程中;③结果证实:SFRP1,骨形态发生蛋白7,PAX2,SMAD3,RUNX2,JUN,ESR1,GNAS基因在牙周重建过程中起关键作用.牙周重建过程极有可能开始于骨组织改建,包括成骨细胞分化和成骨细胞增殖,接下来是成纤维细胞增殖.
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背景:参苓白术散是健脾祛湿的代表方之一,具有良好的抗炎及免疫调节效应.近年来课题组在临床实践中发现对早、中期膝骨关节炎患者使用参苓白术散疗效颇丰,但具体的分子机制尚不明确.目的:通过网络药理学和分子对接探究参苓白术散治疗膝骨关节炎的药理学机制.方法:使用TCMSP和TCMID数据库搜集参苓白术散活性成分及其作用靶点,使用GenneCards和OMIN-NCBI数据库获取膝骨关节炎靶点,使用STRING与Cytoscape构建药物-活性化学成分-核心靶标网络与PPI蛋白网络互作分析,并进行GO及KEGG分析
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背景:转基因植物可食性疫苗是以植物作为载体,将外源性基因整合到植物基因组当中,进一步激活动物或人体免疫系统以获得特异性免疫能力.但外源性基因的持续低表达量一直无法达到满意的免疫效果.目的:用分子生物学技术检测转基因番茄植株中pacA-ctxB融合基因表达及目的蛋白的表达量,为进一步观察可食用防龋疫苗的防龋效果提供研究基础.方法:①提取转基因番茄叶片总DNA,PCR检测外源性融合基因pacA-ctxB,实验分组3组:阳性对照组为质粒p2355-EPC10;空白对照组为普通番茄1株(红抗219);转基因组为转
背景:已有研究证实,左旋肉碱、泛酸、辅酶Q10等营养因子能改善机体能量代谢,是能量转换过程中必不可少的成分,联合使用这3种营养因子是否能产生更好的运动疲劳保护效应,目前还不是很清楚.目的:探讨联合使用左旋肉碱、泛酸、辅酶Q10对小鼠运动性疲劳是否具有改善作用,联合使用的最佳组合方式以及改善运动性疲劳的作用机制.方法:①动物分组:雄性ICR小鼠100只,利用正交设计原理,设定4种因素分别为左旋肉碱(A)、泛酸(B)、辅酶Q10(C)营养因子及游泳运动(D),3种剂量水平营养因子分别为水平1(不使用)、水平2
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背景:骨关节炎以关节软骨的退变为主要病理特征,作为软骨中唯一的细胞,软骨细胞的衰老是骨关节炎发病的重要机制之一.但是骨关节炎的具体发病机制目前仍未清楚,因此探索疾病过程中的分子机制和信号通路变化,希望为骨关节炎的诊断与治疗提供新的生物靶点和研究方向.目的:探讨在骨关节炎进程中软骨PDZ结构域蛋白1(PDZ Domain Containing 1,PDZK1)对软骨细胞衰老的影响.方法:①8周龄C57/BL6小鼠随机分为实验组和假手术组,实验组又随机分为4,8周2个亚组.实验组小鼠行右侧膝关节内侧半月板胫骨
背景:近年来肌腱病是一种高发的骨科慢性损伤,目前仍缺少有效的治疗手段,川续断具有补肝肾、强筋骨、续折伤等功效.目的:旨在研究川续断中主要成分川续断皂苷Ⅵ对兔肌腱病的修复作用.方法:48只兔随机分为正常组(n=8)、模型组(n=32)和生理盐水组(n=8),其中模型组于左跟骨附着点注射前列腺素E2建立兔跟腱病模型,随后随机分为4个亚组,分别采用0,10,20,40 mg/kg川续断皂苷Ⅵ治疗,1次/d,连续4周.动物实验于2019-11-04经成都体育学院动物伦理委员会批准,批准号:成体伦理[2020]21
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背景:临床研究表明桂枝芍药知母汤治疗痛风性关节炎效果显著,但其分子作用机制尚未明确.目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨桂枝芍药知母汤治疗痛风性关节炎的潜在分子机制.方法:利用中药系统药理学数据库及分析平台筛选桂枝芍药知母汤的活性成分及对应靶点,整合Gene Cards,OMIM和DigSee数据库的查询结果获取痛风性关节炎相关靶点,然后利用Venny平台进行映射取交集得到桂枝芍药知母汤治疗痛风性关节炎的潜在作用靶点.利用Cytoscape软件构建桂枝芍药知母汤治疗痛风性关节炎的“单味药-活性成分-作用