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重大传染病发生后若应对不当，往往会借助自然系统或社会系统之间相互依存和相互制约的关系迅速扩散演化，产生一系列次生衍生事件。以重大传染病的发生和发展过程为基础构建其扩散模型，利用系统动力学仿真软件比较不同防控情形下系统演化结果，结果表明：（1）通过对疾病接触系数、自由传播期、开始防控时间进行控制可以改变重大传染病的扩散演化；（2）单独限制人口流动虽可降低传染速率但无法抑制重大传染病的扩散，而同时采取限制人口流动和隔离措施的效果优于单独采取隔离措施。