妊娠期的孕妇得了尿路感染，这是一个棘手的问题。因为用药不当容易引起畸胎。
　　妊娠期间，孕妇体内各系统会发生一系列变化：输尿管易于发生扭曲；输尿管蠕动减弱；增大的子宫压迫输尿管，易发生肾盂积水。在妊娠期，由于生理原因，常会出现无症状的“妊娠期菌尿”，这也是发生肾盂肾炎的重要基础。有资料称，妊娠期肾盂肾炎的发病率达0.5％—0.8％。
　　妊娠期一旦得了肾盂肾炎，必须用有效的抗菌药物治疗，当然，应警惕对孕妇与胎儿有害的药物。理想的药物要求安全而有效。
　　用药前，必须作尿液细菌培养、菌落计数及药物敏感试验。医药界对孕期尿路感染的药物选择有如下见解：
　　氨基糖甙类：常用的庆大霉素、丁胺卡那霉素可损害胎儿的听神经而引起先天性耳聋，故不宜使用。
　　复方新诺明：在妊娠16周以前使用可能致畸胎；在产前2周使用可能引起新生儿“核黄疸”，故只适用于妊娠中期。
　　呋喃坦啶：一般可以使用。对个别人可引起溶血性贫血。
　　氨苄青霉素：对青霉素不过敏的病人，可以放心使用。
　　头孢菌素类：可以使用。第一代头孢菌素(如头孢拉定)疗效较差；第二代头孢菌素对尿路感染的疗效甚好，但对青霉素过敏者要慎用。
　　瞳诺酮类：目前使用的第三代喹诺酮药有氟哌酸、氟嗪酸、环丙氟哌酸和左氧氟沙星等。喹诺酮类口服使用很方便，对尿路感染的疗效甚佳。由于早年以氟哌酸做动物试验，发现其可引起幼犬和胎鼠的软骨损害，故认为孕妇及儿童不宜使用。但另据近年来在国内外做的动物试验发现，试验动物的胚胎无异常。分析原因是早年用氟哌酸做动物试验时采用了“超剂量”。另据国内的资料，接受氟哌酸治疗的患儿，在治疗期和治疗后，并没有不良反应，许多患者在用药后长期随访至15岁，对长骨进行x线摄片，也没有软骨损害的证据，故许多学者认为，从循证医学的角度来说，如果剂量合适，使用还是安全的。