费氏中华根瘤菌HN01pmrA所在基因簇的结构分析

来源 :广西农业生物科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:gaolch003
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经原位杂交,从费氏中华根瘤菌HN01基因组文库中钓出含有pmrA基因的阳性克隆pGXHN300,对其进行亚克隆测序得到pmrA两翼6.8kb的DNA序列。生物信息学分析显示,该序列包括6个完整的ORF和1个不完整ORF。pmrA所在的基因簇含有4个0RF:ORFa、ORFb、ORFc、ORFd(pmrA)。其中,0RFa与Rhizobium etli的cysG(CAA04958.1)在氨基酸水平一致性为79%,相似性为87%。对ORFc序列分析发现与亚硫酸及亚硝酸还原相关的保守结构域。通过融合PCR方法,
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