组蛋白H3K9me3在胆管癌发生机制中的作用

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目的

观察组蛋白H3K9me3修饰在胆管癌发病机制中的作用。

方法

收集9例病理确诊的胆管腺癌组织和5例正常的肝外胆管组织,采用染色质免疫共沉淀联合芯片技术(ChIP-chip)检测两种组织细胞全基因组的蛋白H3K9me3修饰水平,进行基因验证,并检测mRNA的表达水平。

结果

与胆管组织细胞比较,胆管癌细胞全基因组范围共筛选出67个基因存在H3K9me3修饰显著差异,其中35个基因升高,32个基因降低。在癌细胞中,6个挑选基因[钙结合蛋白A2(S100A2)、GTP酶激活蛋白基因2亚型(ANAPC2)、CBFA2T3、GTP酶激活蛋白4(ARHGAP)、鸟嘌呤核苷酸交换因子3(RAPGEF3)、α型蛋白激酶C基因(PRKCA)]的H3K9me3修饰水平分别为:(3. 51± 0. 21)%、(8. 45±0. 16)%、(0. 89±0. 27)%、(0. 66±0. 22)%、(0. 04±0. 01)%、(5. 21±1. 53)%,与正常胆管细胞比较差异有统计学意义,并且其修饰水平与基因表达呈负直线相关(r=-0. 539,P< 0. 05)。

结论

与正常胆管细胞比较,胆管癌细胞中多个基因的组蛋白H3Kme3修饰水平存在显著改变;并导致了多个相关的癌基因及抑癌基因转录表达的改变。

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