2006–2014年中国八省份肠致病性大肠杆菌分离株的多位点序列分型分析

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目的

了解2006–2014年分离自我国8个省份不同宿主的肠致病性大肠杆菌(EPEC)的分子分型特征。

方法

于2006–2014年,从我国8个省份的腹泻病例、动物粪便、食品中分离大肠杆菌菌株,根据分离年代、地点、宿主来源以及PFGE带型特点,选取其中的149株EPEC分离株。选择大肠杆菌多位点序列分型(MLST)数据库提供的7个管家基因,采用SeqMan II、MEGA 5.05、eBURST V3等软件,对已有的国内外392株菌(大肠肝菌MLST数据库中包含的菌株为243株,本次研究采集的菌株为149株)的173个ST型进行聚类分析。

结果

56种ST型别中,ST-40型菌株比例较高,占12.8%(19/149),为优势型别菌株;新ST型别有19种,7个管家基因中有6个(adkfumCgyrBicdmdhpurA)检测到11种新等位基因型。同时包括腹泻病例和动物粪便来源的菌株的ST型别为6种,其EPEC类型均为非典型EPEC(aEPEC);同时包括腹泻病例和食品来源的菌株的ST型别为2种,其EPEC类型均为非典型EPEC(aEPEC)。eBURST聚类分析显示,173种ST型别中,33种ST型别形成了5个主要ST序列群,分别为STC-29、STC-10、STC-20、STC-28和STC-517,其余140种ST型别菌株散在分布于其他克隆群中或为单例。

结论

我国8个省份的EPEC分离株的ST型别呈高度多样性,与腹泻患者分离株存在相同ST型的动物粪便和食品分离株的EPEC类型均为aEPEC。

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