猪流行性腹泻病毒M蛋白B细胞表位预测分析

来源 :辽宁医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zisanjie
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目的 分析TGEV.M蛋白的B细胞表位,为试验确定TGEV M蛋白的B细胞表位和开发TGEV重组亚单位疫苗研究奠定基础;方法以TGEV M蛋白氨基酸序列为基础,分别采用Garnier-Robson、Chou-Fasman和Karplus-Schulz方法预测M蛋白的二级结构,以及利用在线TMHMM Server v2.0软件分析M蛋白的跨膜区;之后,分别按Kyte-Doolittle,Emini和Jameson-Wolf方案预测TGEV M蛋白的B细胞表位;结果预测结果表明,在FGEV M蛋白N端共同α-螺旋区段为4个;共同的β-折叠区段分别为13个;共同的转角区域分别为7个;柔性区域为12个;M蛋跨膜区3个;结论TGEV M蛋白N端第19~43、103~109、138~155、198~205、220~228和237~257区段内或附近很可能是B细胞表位优势区域.
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