慢性丙肝患者高通量测序TCR-CDR3免疫组库研究

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目的探讨HCV感染患者外周血TCRβV基因重组的多样性以及发现可识别丙型肝炎病毒的T细胞受体。方法分离HCV感染患者的外周血淋巴细胞提取RNA,反转录为c DNA一链,进行多重PCR扩增,构建测序文库,进行高通量测序,分析其TCR多样性以及表达的差异。结果 6例HCV感染患者运用Illumina Miseq测序平台测序,去除冗余后的氨基酸序列,得到151246个CDR3有效序列,建立TCR-CDR3免疫组库,将V-J基因结合,得到6个样本均高频配对TRBJ1-1–TRBV19(3.92%),TRBJ1-1–TRBV2(3.17%),,用皮尔森相关系数分析得r=0.83。结论推测其TRBJ1-1–TRBV19、TRBJ1-1–TRBV2可能参与HCV感染的发病、免疫应答等。
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