【目的】明确江西省南昌市郊区莴笋链格孢叶斑病病原菌种类，筛选出能有效防治该病害的生防菌剂。【方法】采用组织分离法对莴笋链格孢叶斑病进行病原菌分离纯化，选择代表性菌株WS1作为供试菌株进行孢子悬浮液刺伤接种，再对接种发病的病斑进行病原菌再分离，以完成柯赫氏法则验证，最后对分离所得病原菌进行形态学鉴定；采用真核生物核糖体基因转录间隔区rDNA-ITS以及过敏原基因Alta1分别对病原菌进行PCR 扩增和序列测定，使用BLAST软件，在GenBank中进行序列同源性比对，并利用MegA7.0软件构建系统发育树，以对病原菌进行分子鉴定。采用对峙培养法测定8种常见市售生防菌剂对该病原菌的室内抑菌效果。【结果】共分离获得23个培养性状一致的链格孢菌株，其对莴笋叶片均具有致病性。病原菌在PDA培养基上菌落圆形，中间灰褐色，边缘白色，菌丝体茂密呈绒状，后期正面中央颜色加深成暗青褐色，背面呈黑褐色，菌落平均生长速度10.86 mm·d-1。分生孢子倒棍棒形或椭圆形，淡褐色至褐色，具0～6个横隔、0～3个纵隔和0～2个斜隔，孢身大小（14.60～40.09）μm×（6.61～14.44）μm。短喙柱状或锥形，淡褐色，大小（1.84～8.29）μm×（2.60～4.35）μm。分生孢子链生于分生孢子梗上，主链一般不超过10个孢子，支链不超过5个孢子。其培养性状和形态特征与文献中对交链格孢（Alternariaalternata）的描述相吻合。测定的rDNA-ITS和Alta1 基因的序列长度分别为570bp和472bp，序列登录号分别为OP161641和OP185144，与GenBank中交链格孢对应序列的同源性均为100%，并在系统发育树上处于同一个分支且支持率为99%。通过形态学和分子生物学将此病原菌鉴定为交链格孢（A. alternata）。在室内生防菌剂筛选试验中，地衣芽孢杆菌、荧光假单胞菌、解淀粉芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌、侧孢芽孢杆菌、蜡质芽孢杆菌、胶质芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌的抑菌率均高于63%，其中地衣芽孢杆菌和荧光假单胞菌抑菌效果突出，抑菌率分别高达75.42%和72.74%。【结论】确定江西省南昌市郊区莴笋链格孢叶斑病的病原菌为交链格孢（A. alternata），地衣芽孢杆菌和荧光假单胞菌可作为下一步莴笋链格孢叶斑病田间防效试验的候选生防菌剂。