【摘 要】
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卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）是高耗氧率的鱼类，低氧极易导致其死亡。筛选其耐低氧性状InDel分子标记并挖掘影响耐低氧性状的功能基因，可为选育具有较强耐低氧能力的卵形鲳鲹提供有益指导。利用全基因组重测序技术分析了卵形鲳鲹基因InDel差异，挖掘卵形鲳鲹与耐低氧性状显著关联的InDel位点，并探讨了与耐低氧性状相关的候选基因。结果表明，测序共获得693.48 Gb数据，其中Q30的
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（U20A2064）； 财政部和农业农村部:国家海水鱼产业技术体系资助（CARS-47）； 国家重点研发计划项目（2018YFD0900301）； 中国水产科学研究院中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金资助（2020TD29）；
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卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）是高耗氧率的鱼类，低氧极易导致其死亡。筛选其耐低氧性状InDel分子标记并挖掘影响耐低氧性状的功能基因，可为选育具有较强耐低氧能力的卵形鲳鲹提供有益指导。利用全基因组重测序技术分析了卵形鲳鲹基因InDel差异，挖掘卵形鲳鲹与耐低氧性状显著关联的InDel位点，并探讨了与耐低氧性状相关的候选基因。结果表明，测序共获得693.48 Gb数据，其中Q30的平均值为90.8%，注释分析发现了共2 574 178个InDel位点。敏感组50尾卵形鲳鲹所特有的InDel共249 395个，其中2 209个位于外显子上，在核苷酸切除修复信号通路和细胞黏着分子中存在变异基因。将InDel位点与耐低氧性状关联分析发现，3个InDel位点（InDel 22883061、InDel 24919481和InDel 14451779）接近显著性阈值，注释分析获得了9个候选基因。筛选到的InDel位点对后期分子标记选择育种的选择和鉴定有重要价值，注释到的候选基因为卵形鲳鲹耐低氧的机理研究提供了基础和依据。
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