【摘 要】
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目的 基于生物信息学构建糖尿病肾病（diabeticnephropathy，DN）竞争性内源RNA（competingendogenousRNA，ceRNA）网络，预测治疗DN潜在有效中药。方法 利用GEO数据库与R语言获取DN差异表达长链非编码RNA（differentiallyexpressedlncRNA，DElncRNA）及差异表达信使RNA（differentiallyexpressed
【基金项目】
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辽宁省“兴辽英才计划”青年拔尖人才项目（XLYC1807145）； 辽宁省人社厅百千万人才资助项目（20200512）；
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目的 基于生物信息学构建糖尿病肾病（diabeticnephropathy，DN）竞争性内源RNA（competingendogenousRNA，ceRNA）网络，预测治疗DN潜在有效中药。方法 利用GEO数据库与R语言获取DN差异表达长链非编码RNA（differentiallyexpressedlncRNA，DElncRNA）及差异表达信使RNA（differentiallyexpressedmRNA，DEmRNA），借助miRcode、TargetScan、miRTarBase、miRDB数据库整合“DElncRNA-微小RNA（microRNA，miRNA）”与“miRNA-DEmRNA”调控关系，通过Cytoscape3.7.2软件构建ceRNA调控网络，采用Metascape平台分析ceRNA调控网络主要涉及生物过程及信号通路，借助String数据库与Cytoscape3.7.2软件获取关键基因，并将其映射到CoremineMedical数据库中，预测治疗DN潜在中药，通过TCMSP、PubChem、UniProt、SwissTargetPrediction数据库结合文献收集整理预测中药的核心成分与对应靶点，构建“中药-活性成分-靶基因”网络，采用AutoDockTools、PyMOL对主要活性成分与关键基因进行分子对接。结果最终获得由9个lncRNA，33个miRNA，106个mRNA所构成的ceRNA网络，主要涉及血小板衍生生长因子受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（mitogenactivatedproteinkinases，MAPK）级联、对雌二醇的反应等生物过程以及磷脂酰肌醇-3-羟激酶（phosphatidylinositol-3-hydroxykinase，PI3K）/蛋白激酶B（proteinkinaseB，Akt）、p53、血管内皮生长因子（vascularendothelialgrowthfactor，VEGF）等信号通路。中药预测结果显示，雷公藤、藤黄、黄芪、三七等多味中药与DN密切相关，槲皮素、藤黄酸、异藤黄酸、山柰酚、gambogellicacid与关键基因具有良好的亲和力。结论 ceRNA调控网络的构建有助于对DN发病机制的进一步理解，预测中药可能成为治疗DN潜在药物来源。
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