【摘 要】
：
目的 应用Ion Torrent PGM半导体测序仪和Ion AmpliSeqTMInherited Disease Panel对3例马凡综合征(Marfan syndrome,MFS)进行致病基因突变检测,明确其致病突变,并评价下一代半导体靶向测序诊断复杂单基因遗传病的效果.方法 在知情同意的基础上采集3例MFS患者及1名正常志愿者外周血,提取基因组DNA,经多重PCR扩增富集目的基因片段.每个
【机 构】
：
100005北京,中国医学科学院基础医学研究所McKusick-Zhang医学遗传学中心,100005北京,中国医学科学院北京协和医院心内科及临床遗传学实验室,100005北京,中国医学科学院基础医学
论文部分内容阅读
目的 应用Ion Torrent PGM半导体测序仪和Ion AmpliSeqTMInherited Disease Panel对3例马凡综合征(Marfan syndrome,MFS)进行致病基因突变检测,明确其致病突变,并评价下一代半导体靶向测序诊断复杂单基因遗传病的效果.方法 在知情同意的基础上采集3例MFS患者及1名正常志愿者外周血,提取基因组DNA,经多重PCR扩增富集目的基因片段.每个样本用特异性序列标签进行标记后,应用Ion One Touch系统进行模板制备、乳化PCR及磁珠颗粒富集；最后用318半导体测序芯片进行高通量测序.用Ion Torrent Suite 3.2软件进行序列比对及SNPs和Indels提取,再用dbSNP 137数据库过滤得到SNPs和indels,剩余的可疑突变经Sanger法测序验证.结果 用一张318芯片得到855.80Mb的总数据量,4个样本的平均测序深度均达到100×以上,对目的区域的覆盖度在98％以上.数据经软件分析及数据库过滤后,在3例MFS患者中分别得到3个FBN1基因可疑突变,并经Sanger法测序验证,一个为已报道FBN1基因错义突变(p.E1811K),另外两个为新发现的突变,包括一个无义突变(p.E2264X),1个插入突变(p.L871FfsX23).结论 在3例MFS患者中都成功检出FBN1基因致病突变,表明半导体靶向测序可对复杂单基因遗传病进行高效、准确的基因诊断。
其他文献
转化医学是指将与医学有关的研究,尤其是基础研究的成果转化为临床可应用的药物、方法、技术和理念,为患者疾病的临床诊断、治疗和预防服务.医学本身就是一门转化学科,原本就具有很强的实用性和目的性.转化医学现今受到高度重视,是因为人们对科学研究或科学实验的重要性有了新认识,并且科学研究,包括人类和医学遗传学研究也取得了重要的进展。
目的 对1个姨表近亲结婚的遗传性凝血因子V（coagulation factorV，FV）缺陷症家系进行基因分析，探讨其分子发病机制。方法检测先证者及其家系成员的凝血酶原时间（prothrombin time，PT）、活化部分凝血活酶时间（activated partial thromboplastin time, APTT）、纤维蛋白原（fibrinogen，FIB）、血浆FV活性（FV：C）和
目的 了解男性少、弱精子及无精子症患者与染色体核型的关系,以明确男性不育的病因.方法 对175例经精液常规和形态检测,临床诊断为少、弱精子及无精子症的男性患者,抽取外周静脉血进行淋巴细胞培养、制片、核型分析.结果 175例少、弱精子及无精子症患者的细胞遗传学分析结果中检出染色体异常者67例,总检出率为38.29％.其中染色体结构异常者11例,占6.29％,染色体数目异常者35例,占20.00％,染
神经退行性疾病是一组病因不明的慢性进行性神经损害.蛋白质的错误折叠和聚集是这类疾病共同的病理特征.热休克同源蛋白70羧基端作用蛋白(carboxyl-terminus of Hsc70 interacting protein,CHIP)具有双重功能,一方面可作为热休克蛋白的辅助因子,通过氮基端的34肽重复序列结构域与Hsp90和Hsc/Hsp70相互作用,调节热休克蛋白介导的蛋白质异常折叠,同时又
例1男,21岁,主诉"结婚1年不育以及少、弱精子症".患者外表及智力正常,常规查体未见第二性征及外生殖器官异常.内分泌检查结果:孕酮28.69 nmol/L(正常参考值8.88～38.0 nmol/L);睾酮11.80 nmol/L(正常参考值9.72～41.64nmol/L);泌乳素0.29 nmol/L(正常参考值0.09～0.89 nmol/L);促黄体生成素1.2 U/L(正常参考值1.0
目的 探讨维生素D受体（vitaminDreceptor，VDR）基因ApaI和TaqI位点多态性与帕金森病（Parkinson’sdisease，PD）遗传易感性的相关性。方法采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性技术和基因测序方法，检测285例中国北方汉族散发PD患者与285名正常对照VDR基因ApaI和TaqI位点多态性，并比较两组基因型和等位基因频率的差异。结果A抛I和TaqI位点基因型和
家系1 先证者,女,24岁.结婚2年,2次妊娠均于2月左右胚胎停止发育.月经规律.夫妻非近亲结婚,否认有遗传病家族史.孕期无患病及服药史,无有毒有害物质及放射线接触史.查体:妇科检查正常,优生四项检查及内分泌检查无异常。
患儿男，45d。孕1产1，孕37周顺产，出生体重3150g。出生后博乳喂养。因皮肤黄染43d，口唇青紫35d而就诊。查体：身长53cm，体重4．8kg。肝肋下2cm，质地中等；脾肋下2．5cm触及。
目的 建立用聚丙烯酰胺凝胶电泳法（polyacrylamidegelelectrophoresis，PAGE）同时快速检测正常核型急性髓细胞白血病（cytogeneticallynormalacutemyeloidleukemia，CN—AML）患者FLT3-ITD和NPM1基因突变的方法。方法在多重PCR基础上，用毛细管电泳法（capillaryelectrophoresis，CE）和PAGE凝
患者 女,27岁.妊娠2次,均于孕2个月左右自然流产.妊娠期间无服药和不良因素接触史,患者智力和表型均正常.外周血染色体核型检查结果:45,XX,t(4;7;6)(4pter→4q31∷6p21.3→ 6pter;7pter→ 7q21∷ 4q31→ 4qter;6qter→ 6p21.3∷7 q21→ 7qter),der(13;14)(13qter→cen→ 14qter),见图1.其丈夫核型