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本研究收集了黑龙江省43个栽培品种，国际热带农业中心13个半野生品种，波兰4个矮生品种共60个菜豆品种资源，将其分成三大类型，即蔓生种35个，矮生种12个，半野生种13个，分别从形态学、等位酶及RAPD标记上进行了研究，探明种内及各种群间的遗传相似度、遗传距离，绘制聚类分析图。 1.测定60份菜豆种质植物学、生物学性状，通过编制的计算机软件程序，采用标准差标准化方法，计算各材料间的欧氏距离，其范围为0.11-0.985。同时对其开展亲缘关系系统聚类图，将其分为两大类，即矮生种为一类，蔓生种及半野生种合为一类，说明形态标记是一种较浅显的分类方法。 2.对60个菜豆种质进行10个酶系统检测，共获得25个位点，多态位点比率为0.16。其平均遗传距离为0.0568。采用平均距离法，将该品种资源聚成8大类，其中蔓生种占5类，矮生种2类，半野生种2类。说明蔓生种遗传距离较远，可作为育种材料储备种质资源。 3.采用简易SDS方法从60份菜豆幼叶中提取基因组DNA，使用经过筛选的29个引物共检测到314个位点，多态位点比率为0.854，其中蔓生种多态位点比率最高达0.958，矮生种为0.733，半野生种为0.573，说明60个菜豆种质资源中蔓生种多态位最强。 4.根据Shannon指数和Nei指数的估测，菜豆种内的遗传多样性主要分布于蔓生种群内，在所研究的蔓生、矮生、半野生种群中，蔓生种群的遗传多样性水平最高，矮生种群其次，半野生种群最次。种群内平均遗传相似度为0.8053，种群间为0.7514。种群内的平均遗传距离为0.1947，种群间为0.2419。在全部314条扩增带中，有10条谱带分别为蔓生种所特有，矮生种及半野生种分别有1条特征谱带，说明蔓生种的遗传变异水平较大。 5.综合形态学、等位酶、RAPD标记三种分类聚类图，结果表明：蔓生种群分为五大类；矮生种群分为二大类；半野生种群分为二大类。 6.黑龙江省是我国菜豆的主要育种、栽培地区，收集国内外菜豆种质资源，由浅入深地开展形态标记、等位酶标记、DNA水平的分子标记将有助于了解菜豆种内、各种群间的遗传基础，确定各资源材料间的亲缘关系，为黑龙江省菜豆种质资源的保存及培育优良品种工作提供一定的理论依据。